Što je retrotranspozon?

Transpozoni su dijelovi DNK koji su pokretni ili se mogu kretati na različita mjesta unutar genetskih informacija stanice. Premještanjem na novo mjesto unutar genoma stanice, transpozoni mogu uzrokovati pojavu mutacija, kao i promjenu količine DNK koja se nalazi unutar stanice. Oni se također nazivaju geni za skakanje, a grupirani su u dvije kategorije, a to su transpozoni klase II i transpozoni klase I, ili retrotranspozoni. Razlika između ove dvije klase je u tome kako se kreću; retrotranspozon ima proces kretanja u dva koraka.

Metoda kretanja segmenta DNK je način na koji se transpozoni klasificiraju u svaku kategoriju. Transpozon klase II je dio DNK koji se kreće s jednog mjesta na drugo. Kretanje transpozona klase I, ili retrotranspozona, mnogo je složenije i uključuje dva koraka za kretanje segmenta DNK.

Prvi korak za kretanje retrotranspozona je stvaranje segmenta RNA kroz transkripciju dijela DNK. RNA se sada može slobodno kretati kroz genom jer nije vezana za lanac DNK. Kada RNA dođe na novo mjesto, specifični enzim, nazvan reverzna transkriptaza, stvara novi lanac DNK na temelju RNA segmenta. Ovaj novi dio DNK se zatim veže na novo mjesto unutar genoma.

Kada se retrotranspozon transkribira natrag u segment DNA iz RNA kopije, obično ima duge terminalne ponavljanja (LTR) na kraju DNA sekvence. LTR se sastoje od ponavljajućih nizova baza koje mogu biti duge stotine ili čak tisuće baza. Obično okružuju funkcionalni dio DNK, kao što je gen, i neophodni su za pričvršćivanje segmenta DNA na izvorni lanac DNK. LTR su jedan od načina na koji znanstvenici mogu prepoznati da dio DNK sadrži retrotranspozon. Smatra se da se oko 42% cjelokupnog ljudskog genoma sastoji od retrotranspozona.

Zbog činjenice da se nove kopije DNK stvaraju putem reverzne transkripcije RNA, dodavanje retrotranspozona je način da se poveća količina DNK koja se nalazi unutar jedne stanice. Ako je retrotranspozon umetnut unutar gena ili blizu gena, to može uzrokovati mutaciju. Mutacije su u osnovi promjene u sekvenci DNK i mogu imati pozitivan, negativan ili nikakav utjecaj na genom, ovisno o tome kako je slijed DNK promijenjen.