Rezistencija na klindamicin odnosi se na soj bakterija koji je jednom ubio klindamicin, ali je razvio imunitet protiv lijeka. Bakterija je živi organizam koji se može prilagoditi svom okruženju radi preživljavanja. Antibiotska terapija ubija ranjive bakterije, ali jači bakterijski sojevi ostaju i razvijaju načine da se odupru toksičnim učincima antibiotika klindamicina. Kako se bakterije množe i prenose snagu prilagodbe na svoje potomstvo, populacija bakterija razvija široku otpornost na lijek. Sposobnost bakterija da se prilagode i odupru učincima klindamicina naziva se rezistencija na klindamicin.
Antibiotski lijek, klindamicin, razvijen je za suzbijanje uobičajenih infekcija uzrokovanih anaerobnim bakterijama poput malarije, kožnih infekcija, toksoplazmoze, peritonitisa, infekcija dišnog sustava i zubnih infekcija. Ove bolesti su uglavnom infekcije stečene u zajednici i stoga su prisutne u vrlo velikom broju u vrlo širokom rasponu okruženja. Unutar tako ogromnog okruženja, bakterije koje uzrokuju ove infekcije imaju prostora da se prilagode i prilagode. Ovisno o vrsti bakterije i načinu prilagodbe, bakterije su u stanju neutralizirati učinke klindamicina ili se brže razmnožavati tako da nadmašuju učinkovitost lijeka.
Problem rezistencije na antibiotike, uključujući rezistenciju na klindamicin, postao je svjetski zdravstveni problem. Bolesti koje su jednom poražene antibiotskom terapijom doživljavaju porast u broju, šireći se širom svjetske populacije neometano ili sa skupim i teškim alternativama liječenja. Infekcija Staphylococcus aureus (MSRA) otporna na meticilin, ili “superbug” kako se često naziva, prijeteći je primjer rezistencije na klindamicin. Ova uobičajena, zarazna infekcija kože može se razviti u vrlo tešku bolest koja uništava meso ili je smrtonosna. Jedini tretman za neke MSRA infekcije je uklanjanje bolesnog dijela tijela ili amputacija zaraženog ekstremiteta.
Kako bi spriječili strašne učinke rezistencije na klindamicin, medicinski stručnjaci savjetuju suzdržanost u korištenju antibiotika i pravilnu primjenu lijekova uz antibiotsku terapiju. Klindamicin nije prikladan za virusne infekcije poput prehlade, gripe, bronhitisa i mnogih infekcija uha. Antibiotik treba davati samo za soj bakterija na koji utječe. Pacijenti bi trebali ispuniti cijelu propisanu dozu kako bi u potpunosti ubili sve vrste bakterija u tijelu.