Što je totalna izolacija RNA?

Izolacija ukupne ribonukleinske kiseline (RNA) je laboratorijska tehnika koja se koristi za ekstrakciju cjelokupne stanične RNA iz uzorka tkiva. To se razlikuje od ostalih metoda obrade koje selektivno izvlače određene vrste RNA. Istraživač bi, na primjer, mogao htjeti pregledati glasničku RNA (mRNA) i mogao bi raditi s uzorkom kako bi izvukao upravo ovaj genetski materijal. Dostupni su brojni laboratorijski protokoli za potpunu izolaciju RNA, koristeći različite proizvode znanstvenih dobavljača.

Prikupljanje cjelokupne stanične RNA iz uzorka tkiva može imati brojne prednosti. To može dati više čistih i upotrebljivih informacija. Tehnika također može omogućiti istraživačima da provjere degradaciju koja bi mogla uzrokovati probleme s eksperimentima. Ako je uzorak loše kvalitete, istraživač može ponovno izdvojiti RNA kako bi dobio čišću i korisniju kolekciju RNA. To može biti važno za mnoge vrste istraživanja, gdje loša RNA na početku uzrokuje probleme s eksperimentima u nastavku.

Tehnike za izolaciju ukupne RNA mogu uključivati ​​razne kemijske agense. Neki se usredotočuju na korištenje netoksičnih kemikalija kako bi se smanjio rizik od oštećenja uzorka. Takve kemikalije također ograničavaju nizvodno onečišćenje RNA i sigurnije su za laboratorijske radnike. Laboratoriji nastoje odabrati određenu kemikaliju i protokol za preporuku svom osoblju i uključiti detaljan opis cjelokupnog postupka izolacije RNA u svojim priručnicima. To osigurava dosljednost u obradi RNA u postrojenju kako bi se dobili stabilniji i korisniji rezultati.

Proces počinje pripremom uzorka tkiva, koji može varirati u veličini, kako bi se pripremio za tretman koji kemijskim reagensima izvlači ukupnu RNA. Tehničari konzultiraju laboratorijski priručnik kako bi odredili kako rukovati uzorkom i tretirati ga kako bi se izolirala RNA. Mogu koristiti alate poput ploča za elektroforezu kako bi provjerili kvalitetu uzorka, tražeći znakove degradacije koji bi mogli ukazivati ​​na problem s procesom izolacije ukupne RNA.

Istraživači mogu provesti vlastitu izolaciju ukupne RNA ili delegirati ovaj zadatak laboratorijskom asistentu, diplomiranom studentu ili sličnom laboratorijskom radniku. Također je moguće ugovoriti izolaciju u druge laboratorije. To ponekad može biti potrebno za zaštitu integriteta eksperimenta korištenjem treće strane za generiranje provjerljivih i ponovljivih rezultata. U svim znanstvenim radovima temeljenim na istraživanju s izoliranom RNA, istraživač treba raspravljati o metodi korištenoj za izolaciju i tko je izvršio posao.