Transgen je dio genetskog materijala iz jednog organizma koji se pojavljuje u DNK drugog organizma. Ovisno o brojnim čimbenicima, transgen se možda neće izraziti, može se eksprimirati na način drugačiji od onoga koji je uočen u izvornom organizmu ili se može eksprimirati u novom organizmu na potpuno isti način na koji je bio u izvornom. Gen se identificira kao transgen kada je sekvenciran u jednoj vrsti, a kasnije identificiran u drugoj.
Neki se transgeni javljaju prirodno. Na primjer, bakterije su vrlo vješta u razmjeni genetskog materijala, čak i među vrstama bakterija, jer im to omogućuje brzu prilagodbu promjenjivom okruženju. To je jedan od razloga zašto je otpornost na lijekove zabrinjavajuća, jer bakterije ne samo da mogu prenijeti otpornost na lijekove na pripadnike svoje vrste, već i potencijalno na pripadnike drugih vrsta.
U drugim slučajevima, transgeni se ubacuju putem genetskog inženjeringa. Genetski inženjering koristi se za sve, od stvaranja transgenih miševa za laboratorijska istraživanja do razvoja novih usjeva koji će biti otporni na sušu. U ovom slučaju, gen od interesa je identificiran i umetnut u genom ciljnog organizma u nadi da će se izraziti po želji. Na primjer, naslovnici su se pojavili početkom 21. stoljeća kada je čovjek tvrdio da je proizveo zeca koji je svijetlio u mraku umetanjem gena meduze u genom zeca.
Transgen se može prenijeti na buduće generacije, što je ponekad razlog za zabrinutost istraživača. Neki ljudi strahuju da bi transgeni organizmi napravljeni u laboratoriju mogli oslabiti divlje populacije istih životinja ili da bi ubacivanje transgena moglo imati neželjene posljedice koje će postati očite tek kada bude prekasno. Kao odgovor na ovu zabrinutost, ponekad se stvara sterilnost tijekom procesa genetskog inženjeringa, kao kod transgenih usjeva za koje se pretpostavlja da se ne mogu ponovno zasijati.
Transgeni se mogu koristiti i proučavati na više načina. Transgen se može koristiti, na primjer, u svrhu kao što je uvođenje ljudske DNK u laboratorijske životinje kako bi se proučavala ljudska patologija bez eksperimentiranja na ljudima. Istraživanje ekspresije gena ili njegovog nedostatka može se također postići upotrebom transgena i transgenih organizama. Ljudi mogu biti znatiželjni, na primjer, o genima koji se čine neaktivnima kod nekih životinjskih vrsta, pitajući se jesu li ti geni ostaci predaka ili se mogu potaknuti na ekspresiju.