Znanstvena klasifikacija je sustav kojim biolozi klasificiraju sav život na Zemlji. Poznata je i kao znanstvena klasifikacija u biologiji ili Linneova klasifikacija, po Carolusu Linnaeusu (1707-1778), koji je prvi pokušao s ovim ogromnim projektom. Pionirsko djelo bila je Systema Naturae, prvi put objavljena 1735., koja je imala dvanaest izdanja tijekom Linnaeusova života. Prva verzija imala je nekoliko tisuća unosa, grupiranih u svojte na temelju zajedničkih fizičkih karakteristika. Danas je znanost priznata preko dva milijuna vrsta, iako se ukupan broj biljnih, životinjskih i jednostaničnih vrsta na Zemlji procjenjuje na između 10 i 100 milijuna.
Sustav znanstvene klasifikacije koji se koristi u biologiji je hijerarhijski, s osam razina kategorizacije. Krećući se od najmanjeg prema najvećem, to su: vrsta, rod, obitelj, red, klasa, tip, kraljevstvo i domena. Između ovih razina često se dodaje još više podjela, budući da sam život nema posebnu obvezu prirodno kategorizirati u samo osam hijerarhijskih razina. Da bismo dali primjer svakog od njih, razmotrimo položaj ljudi u znanstvenoj klasifikaciji. Ljudi su vrste Homo sapiens, rod Homo, porodica Hominidae (veliki majmuni), red Primati, razred Sisavci (sisari), tip Chordata (kralježnjaci i nekoliko bliskih srodnika), kraljevstvo Animalia (životinje), domena Eukarya (eukarioti, organizmi s složene stanice).
Najviše razine znanstvene klasifikacije mijenjale su se nekoliko puta tijekom godina. Godine 1735. Linnaeus je uveo dva kraljevstva: Vegetabilia (biljke i gljive) i Animalia. Godine 1866. njemački biolog Ernst Haeckel uveo je još jedno kraljevstvo, Protista, za sve jednostanične organizme. Godine 1937. francuski biolog Edouard Chatton podijelio je život na dva “carstva” – Prokariota i Eukariota, na temelju detaljnijih promatranja stanica u biljkama, životinjama i bakterijama. Pokazalo se da biljke i životinje imaju temeljne sličnosti u složenosti svojih stanica i prisutnosti staničnih jezgri, dok bakterijama nedostaju i jezgre i organele (unutarstanične strukture).
Još nekoliko velikih ažuriranja uslijedilo je 50-ih, 60-ih i 70-ih godina, što je bilo vrijeme brzog napretka u biologiji. Herbert Copeland je ažurirao sustav na četiri kraljevstva 1956., kada je preimenovao Prokariotu u Monera i podijelio Eukariotu na tri kraljevstva: Protista, Plantae i Animalia. Još jedna promjena dogodila se 1969., kada je Robert Whittaker podijelio Protistu na Fungi i Protista, dajući gljivama svoju vlastitu klasifikaciju najviše razine po prvi put.
Godine 1977. Carl Woese i njegovi suradnici uveli su najnaseljeniji sustav najviše razine do sada, sa šest kraljevstava: Eubacteria, Archaebacteria, Protista, Fungi, Plantae i Animalia. Zatim, 1990. godine, Woese je sustav milostivo pojednostavio, smanjio na tri domene: Bacteria, Archaea i Eukarya. Potonji je trenutno korišteni sustav klasifikacije najviše razine.