Ideja o kamenu mudraca uobičajena je u europskoj mitologiji. JK Rowling je za svoju popularnu seriju o Harryju Potteru posudila ideju o alkemijski stvorenom kamenu s čarobnim svojstvima. U knjigama o Harryju Potteru postoji samo jedan Kamen filozofa, koji je stvorio Nicolas Flamel u 1400-ima. Flamelov kamen može pretvoriti predmete u zlato i proizvesti eliksir života koji pije besmrtnost.
Čarobni predmet se prvi put pojavio u Harryju Potteru i kamenu filozofa, koji je objavljen pod naslovom Harry Potter and the Sorcerer’s Stone u Sjedinjenim Državama. Scholastic, američki izdavač knjiga o Harryju Potteru, vjerovao je da američke čitatelje neće toliko privući knjiga o “kamenu filozofa”. Ovaj izbor je kritiziran, zajedno s amerikanizacijom knjiga o Harryju Potteru objavljenim u Sjedinjenim Državama: male promjene su napravljene u jeziku koji su likovi koristili iz straha da ga Amerikanci neće razumjeti.
Kamen mudraca je ključni element knjige. Nicolas Flamel je prijatelj Albusa Dumbledorea, ravnatelja škole vještičarenja i čarobnjaštva Hogwarts. Njih dvoje su zajedno radili na alkemijskim projektima, vjerojatno radeći sa samim Kamenom filozofa kako bi istražili njegova svojstva. Flamel se također okreće Dumbledoreu kako bi zaštitio kamen, a u ranom dijelu knjige premješten je iz trezora 713 u Gringottsu u Hogwarts, gdje se pretpostavlja da je sigurniji.
Surađujući s nekoliko instruktora u školi, Dumbledore postavlja niz prepreka na put Kamenu filozofa kako bi ga zaštitio. Serija začaranih zaštita osmišljena je kako bi spriječila Voldemorta da dobije Kamen mudraca, jer je Dumbledore zabrinut da će Voldemort ponovno ustati. Naposljetku, Voldemort je sposoban probiti sve zaštite osim posljednje: Dumbledore pametno skriva kamen unutar Zrcala Eriseda na način da ga može dobiti samo netko tko želi pronaći Kamen mudraca, ali ga ne koristiti.
U lekciji o ciljevima i motivima Harry je dobiva jer se gleda u ogledalo bez namjere da ga iskoristi, a također se uspješno odupire pokušaju Voldemorta da nasilno uzme Kamen mudraca. Nakon ove vrhunske scene, Kamen mudraca je uništen kako bi spriječio Voldemorta da ga dobije, a Nicolas Flamel i njegova žena pripremaju se za svoju smrt. Harry je u početku zabrinut za njih dvoje, ali Dumbledore ističe da je Flamel živ više od šest stotina godina i vjerojatno je spreman krenuti u “sljedeću veliku avanturu” smrti.