Tijekom ekstrakcije klorofila, znanstvenik mora oslabiti stanične stijenke zelenog lista ili biljke, a zatim izvući klorofil. Klorofil je smješten unutar svake stanice u zelenom lišću, što biljkama omogućuje fotosintezu. Kao tekućina, klorofil će se izliti iz lišća kada se tretira toplinom i stavi u određene kemikalije. Ovim postupkom uglavnom se uništavaju listovi, pa treba koristiti samo nekoliko listova bilo koje žive biljke, kako bi se očuvao cijeli primjerak.
Vrlo zeleno lišće obično bolje reagira na ekstrakciju klorofila nego blijedozeleno lišće. Špinat, kelj, escarole i bilo koje tamnozeleno lišće s drveća općenito dobro funkcioniraju. Blijede zelene salate i nejasno janjeće uho obično ne djeluju dobro. Listovi također trebaju biti mekani. Tvrdo zimzeleno lišće, poput listova božikovine ili borovih iglica, obično se ne razgrađuje dovoljno da otpusti svoj klorofil. Zimzeleni su razvili mnoge mehanizme za zadržavanje svojih resursa i općenito ih se ne odriču lako.
Prilikom ekstrakcije klorofila listovi se moraju zagrijati i uvenuti. To se može učiniti na jedan od dva načina. Znanstvenik može lišće kuhati na pari stavljajući ih u sito iznad kipuće vode ili ih jednostavno uroniti u vodu. Kuvanje na pari vene i lomi lišće bez pretvaranja u kašu. Neki tvrde da to omogućuje promatračima da jasnije vide ekstrakciju. Oni koji koriste bilo koji način kuhanja trebali bi maknuti lišće s vatre kada su vrlo uvenuli, mekani i savitljivi.
Sljedeći korak u ekstrakciji klorofila uključuje suspendiranje lišća u neku vrstu staklenog spremnika. Prazne staklenke za dječju hranu rade dobro, kao i prozirne staklene čaše za piće. Spremnik koji se koristi za ovaj eksperiment općenito se ne smije koristiti za hranu nakon završetka ekstrakcije.
Znanstvenik tada obično spaja stabljike uvenulog lišća zajedno i nježno ih spaja pamučnim užetom. Kada je vezan za sredinu olovke, uže bi trebalo omogućiti lišću da visi u staklenoj posudi bez dodirivanja dna ili stranica. Iako ovaj korak nije neophodan, znanstveniku omogućuje da ukloni lišće iz posude kako bi pokazao sve promjene boje koje se događaju nakon što je klorofil uklonjen.
Alkohol za trljanje tipična je tekućina izbora tijekom ekstrakcije klorofila. Izvlači klorofil iz lišća u tekućinu. Znanstvenik bi jednostavno trebao napuniti posudu do vrha alkoholom za trljanje i ostaviti sklop da miruje oko 20 minuta. Tekućina bi trebala postati zelena. Kad znanstvenik podigne listove iz tekućine, oni bi trebali biti smeđi jer u njima više nema klorofila.