Obuka o elektroničkom medicinskom kartonu (EMR) obično se provodi tijekom nekoliko tjedana i sastoji se od niza modula koji upućuju medicinsko osoblje o tome kako izraditi elektroničke karte pacijenata, kako propisivati lijekove pomoću digitalnog softvera i kako skenirati tiskanu medicinsku dokumentaciju u pacijentovu digitalna datoteka. Obuka također uključuje upute o korištenju tehnologije za upravljanje laboratorijskim rezultatima i transkripcijama. Dok neke trgovačke škole nude općenite tečajeve EMR obuke, tvrtke za računalni softver koje su specijalizirane za pružanje EMR proizvoda obično dodjeljuju vlastite trenere da osobno usmjeravaju medicinske sestre, liječnike i pomoćno osoblje u korištenju sustava digitalnih zdravstvenih kartona dizajniranog posebno za njihovog poslodavca. Općenito, ne troši se vrijeme na obuku o osnovama korištenja računala, tako da radnicima koji nisu vješti u korištenju računala mogu biti potrebni tečajevi za prethodnu obuku.
Inicijalna sesija EMR obuke mogla bi se provesti dajući pregled cijelog sustava evidencije kako bi se korisnici upoznali s prijavom u softver i pristupom njegovim različitim komponentama. Budući da je dijagram pacijenata primarno sidro bilo kojeg sustava digitalnih zapisa, većina sesija obuke posvećena je stvaranju i ažuriranju dijagrama pacijenta, uz to kako ga čitati, pronaći prijašnje povijesti i dijeliti podatke digitalno. Dijeljenje podataka među medicinskim stručnjacima znači da korisnici moraju naučiti kako koristiti takve EMR komunikacijske značajke kao što su ugrađena e-pošta i objave statusa u stvarnom vremenu.
Tijekom lekcija o izradi grafikona, EMR obuka uključuje pokazivanje medicinskih radnika raznih metoda za unos podataka. Osim tipičnog unosa tipkovnicom, radnici se podučavaju kako unositi podatke pomoću sustava za prepoznavanje rukopisa, diktiranja putem mikrofona ili snimaka te uvoza slikovnih datoteka, grafika i statističkih proračunskih tablica. Ostale sesije tijekom EMR obuke uključuju podučavanje korisnika kako pretraživati digitalne zapise i odrediti prioritete ili sintetizirati nalaze. Radnici također uče kako se prebacivati između nekoliko otvorenih datoteka bez zatvaranja programa ili zbunjujućih informacija. Učenje svih ovih postupaka crtanja, međutim, može biti frustrirajuće za neke, što je potaknulo mnoge trenere da odgode takvu obuku dok korisnici ne nauče jednostavnije postupke, kao što je skeniranje u pacijentovim papirnatim datotekama.
Korištenje softvera za digitalne recepte još je jedan značajan dio obuke. Takav softver može smanjiti pogreške koje proizlaze iz liječničkog lošeg rukopisa. U obuci se radnici ne uče samo kako odabrati određene lijekove za digitalno prepisivanje, već i kako odmah prenijeti recept u elektronički sustav ljekarne. Također mogu naučiti kako ispisati tiskani recept koji pacijent može ponijeti kući. Većina modula za obuku na recept uključuje upute o tome kako koristiti softver za predlaganje zamjenskih lijekova, ispis smjernica za dnevnu upotrebu i identificiranje kontraindikacija za lijekove.
Moduli EMR obuke posvećeni rezultatima laboratorijskih testova među najbitnijim su i najsloženijima. Tehničari uče kako programirati laboratorijski softver za isporuku rezultata izravno u EMR softver i povezati ih s određenim pacijentima. Radnici se također podučavaju kako odabrati najpoželjniji format za laboratorijske rezultate. Nakon što je EMR obuka završena, menadžeri obično zakazuju buduće sesije praćenja kako bi osvježili vještine zaposlenika i podučili aspekte bilo kojeg novog ili nadograđenog softvera.