Liječenje neutropenije u djece varira ovisno o uzroku ovog stanja. Ako je ovaj medicinski problem uzrokovan lijekovima, tada će se upotreba lijekova prekinuti ili će se doza smanjiti kako bi se vidjelo ima li to pozitivan učinak na neutropeniju. Kada je neutropenija uzrokovana teškom infekcijom, koja obično traje dulje vrijeme, dat će se antibiotici ili lijekovi za ublažavanje simptoma i omogućavanje pacijentu da se brže oporavi. Za tešku neutropeniju, obično uzrokovanu smetnjom u proizvodnji neutrofila u koštanoj srži, liječenje se sastoji od faktora koji stimuliraju kolonije granulocita (G-CSF) kako bi se povećala sinteza neutrofila. Kada autoimuni odgovor na neutrofile uzrokuje neutropeniju u djece, liječenje je suzbijanje imunološkog sustava korištenjem steroida.
Mnogi lijekovi za kemoterapiju mogu obuzdati aktivnost koštane srži i smanjiti proizvodnju neutrofila, što dovodi do neutropenije. Najčešći tretman za ovaj uzrok je smanjenje ili širenje liječenja lijekovima ili, ako je moguće, potpuno prestanak primjene lijeka dok se neutropenija ne povuče. Kada to nije moguće, djeca će često biti hospitalizirana kako bi se rizik od infekcije svela na najmanju moguću mjeru, pomno će se promatrati zbog bilo kakvih znakova infekcije te će biti liječena profilaktičkim antibioticima. Roditelji djece oboljele od ove vrste neutropenije moraju dobiti popis znakova upozorenja infekcije ili znakova da se neutropenija pogoršava i budno promatrati svoje dijete.
Dugotrajne ili teške infekcije, osobito u dojenčadi i djece, mogu oslabiti tijelo i iscrpiti ga neutrofilima, uzrokujući neutropeniju u djece. Kada je to slučaj, dijete će se liječiti jakim antibioticima kako bi se ubrzalo uništenje stranog napadača. Lijekovi se također mogu propisati kako bi se smanjili simptomi i omogućilo djetetu da se adekvatno odmori za obnovu tijela. Kada je neutropenija u djece jako teška, dijete se može hospitalizirati kako bi se mogli primijeniti intravenski antibiotici i pomno promatrati djetetovo stanje.
Neutropenija u djetinjstvu, uzrokovana defektom u sintezi neutrofila, liječi se uvođenjem G-CFS liječenja. G-CFS su sintetski hormoni koji pokreću proizvodnju neutrofila u koštanoj srži. Ovaj tretman se primjenjuje, obično jednom dnevno, putem intravenske injekcije. Neutropenija u djece uzrokovana autoimunim odgovorom koji uništava neutrofile obično se liječi steroidima. Ovi lijekovi potiskuju imunološki sustav i omogućuju tijelu da obnovi koncentraciju neutrofila.
Simptomi neutropenije u djece često su teško čitljivi. Kada je dijete liječeno kemoterapijskim lijekovima ili drugim lijekovima za koje se zna da uzrokuju neutropeniju, roditelji bi trebali biti oprezni zbog bilo kakvih znakova infekcije. Ako se netko primijeti, odmah treba pozvati pedijatra ili onkologa. Najčešći znak neutropenije u djece je učestalo i teže oboljenje. Neka djeca također mogu imati natečene ili krvarenje desni.