Naturopatsko testiranje općenito uključuje analizu tjelesnih funkcija korištenjem netradicionalnih medicinskih metoda. Ponekad se uzimaju uzorci krvi za naturopatske pretrage, a može se napraviti i analiza rada srca. Računalni instrumenti mogu se koristiti za analizu energije živčanog sustava kroz akupunkturne točke, dok druge analize mogu pomoći u određivanju netolerancije na hranu, imunoloških problema i toksina povezanih s određenim organima. Probavna funkcija često je dio naturopatskog testiranja, kao i analiza tjelesne masti, vode i sastava kostiju.
Mnogo puta se testovi i analize uzoraka rade u kući uz naturopatsko testiranje. Stručnjak također može poslati uzorke u laboratorij ako je potrebno. Ova vrsta medicinskog testiranja obično se usredotočuje na tjelesnu energiju, uključujući način na koji se smatra da se odnosi na sustavnu ravnotežu i zdravlje različitih organa. Testiranje često zahtijeva uzorke krvi pacijenta. Ponekad se to radi vađenjem krvi iz prsta; mikroskopska analiza se često provodi kako bi se utvrdili nedostaci vitamina i minerala, kao i toksične razine raznih tvari.
Krvni rad također može otkriti visoke razine masnoća i deficite u jetri. Test pod nazivom Digital Pulsewave Analysis obično je u stanju izmjeriti zdravlje arterija, kao i odrediti njihovu biološku starost; Ovim se testom također mogu procijeniti rizici od povezanih bolesti. Naturopatsko testiranje ne može samo detaljno pratiti funkciju srca, već i funkciju autonomnog živčanog sustava zajedno s neurološkim sustavima koji su povezani sa stresom i stanjima mirovanja. Biološki regulatorni procesi često se mjere na ovaj način i u naturopatskoj medicini.
Ostali postupci uključeni u naturopatsko testiranje mogu uključivati analizu tjelesne biokemije. Urin, slina i krv često se testiraju na enzime i molekule, kao i na aminokiseline koje su potrebne za normalno funkcioniranje. Imunitet i toksičnost metala ponekad se analiziraju takvim metodama kako bi se pronašao višak potencijalno štetnih elemenata. Elektrodermalno testiranje općenito uključuje uzimanje očitanja s akupunkturnih točaka, za koje liječnici naturopati vjeruju da profiliraju funkciju unutarnjih organa.
Toksine i minerale možete pronaći i testiranjem kose, jer su mnoge od tih tvari koncentrirane u njoj. Istraživanja u naturopatskoj medicini otkrila su da su određeni tretmani za oči, imunitet i jetru te tretmani boli često učinkoviti za različite dobne skupine. Često se provode ispitivanja različitih tjelesnih funkcija, a naturopatiju kao oblik zdravstvene zaštite nastavljaju proučavati različite istraživačke skupine povezane s velikim institutima i sveučilištima.