FSH, ili folikul stimulirajući hormon, proizvode stanice poznate kao gonadotrofi smješteni u hipofizi u bazi mozga. Hipofiza luči FSH kao odgovor na hormon poznat kao GnRH, ili gonadotropin oslobađajući hormon. GnRH se oslobađa iz drugog dijela mozga koji se zove hipotalamus i putuje krvlju do hipofize. Nakon što se FSH izluči, stimulira testise ili jajnike na proizvodnju spolnih hormona. U onome što se zove negativna povratna sprega, prisutnost spolnih hormona u krvi uzrokuje smanjenje lučenja GnRH iz hipotalamusa i inhibira gonadotrofe u hipofizi da proizvode FSH, što rezultira smanjenjem proizvodnje FSH.
Zajedno s drugim hormonom koji luči hipofiza, poznatim kao luteinizirajući hormon ili LH, folikul stimulirajući hormon je ono što je poznato kao gonadotropin. Kao gonadotropini, i LH i FSH imaju učinak na spolne žlijezde, a to su jajnici i testisi. Kod žena, FSH utječe na sazrijevanje folikula jajnika u kojima se razvijaju jajne stanice, a kod muškaraca FSH pomaže u proizvodnji sperme. I FSH i LH nastaju unutar gonadotrofnih stanica u hipofizi, a svaka se sastoji od alfa podjedinice i beta podjedinice. Dok su alfa podjedinice iste u oba hormona, beta podjedinice, koje se vežu na specifične receptore, su različite.
Pred kraj jednog menstrualnog ciklusa i početkom sljedećeg, folikul koji je ostao nakon ovulacije, poznat kao žuto tijelo, degenerira i njegova proizvodnja spolnih hormona estrogena i progesterona se smanjuje. Ovaj pad razine spolnih hormona stimulira hipotalamus da luči više GnRH, a porast GnRH uzrokuje hipofizu da poveća proizvodnju FSH. FSH tada djeluje na folikule jajnika tako da rastu i sazrijevaju spremni za sljedeći ciklus. Kod muškaraca pomaže u održavanju Sertolijevih stanica koje su neophodne za razvoj spermija.
U žena, nakon krvarenja u menstrualnom ciklusu, proizvodnja FSH nastavlja rasti, a folikuli nastavljaju rasti. Isprva proizvode samo male količine spolnih hormona, no, na kraju, razina raste i počinje negativan povratni učinak, s povećanjem razine hormona u krvi što uzrokuje smanjenje izlučivanja GnRH. Proizvodnja FSH u hipofizi u skladu s tim pada, ali dominantni folikul, koji će proći ovulaciju, nastavlja se razvijati i luči estrogen. Bez progesterona, estrogen ima pozitivan povratni učinak na GnRH, a razine se povećavaju do vrha u ovulaciji, s odgovarajućim vrhom lučenja FSH. Nakon ovulacije, izlučuju se i progesteron i estrogen i njihova razina se povećava sve dok se ne pokrene negativna povratna informacija, otpuštanje GnRH se smanji i proizvodnja LH i FSH se ponovno snizi.