Yersinia pastis je alternativni način pisanja Yersinia pestis, a odnosi se na soj bakterija. Ova bakterija je povezana s crnom kugom i ostaje aktivna u modernom svijetu, iako je općenito ograničena na ograničen broj životinjskih rezervoara. Yersinia pastis je anaerobna i gram-negativna. Infekcija s ovim mikrobom, iako je vrlo ozbiljna, može se uspješno liječiti suvremenim antibiotskim lijekovima, iako se čini da neki sojevi razvijaju otpornost na antibiotike.
Ovaj je mikrob prvi put identificiran i povezan s kugom u kasnom 19. stoljeću, a ta je veza od tada konačno dokazana uz pomoć DNK testiranja. Otkriće Yersinia pastis omogućilo je istraživačima da sastave potpuno razumijevanje tipičnog ciklusa bolesti crne kuge. Bakterije obično prenose domaćinske vrste malih sisavaca, obično štakori, svizci ili slične životinje. Buhe potom prenose mikrob na ljudske domaćine. Prijenos kuge s čovjeka na čovjeka također je moguć, ali je općenito sekundarni oblik prijenosa.
U ljudi se općenito viđaju tri oblika infekcije Yersinia pastis. Najčešća vrsta infekcije, koja se izravno prenosi ugrizom buha, dovodi do bubonske kuge, najčešćeg oblika kuge, koja uzrokuje bolne otekline u limfnim čvorovima i mnoge opće sistemske simptome. Septikemijska kuga nastaje kada mikrob može izravno zaraziti krvotok i vrlo je opasan oblik bolesti, osobito kada se ne liječi. Plućna kuga je infekcija pluća i također je iznimno ozbiljna, ne samo zato što uzrokuje razdražujući kašalj koji omogućuje mikrobu da zarazi nove domaćine prijenosom zrakom.
Yersinia pastis je endemska u mnogim regijama svijeta, uključujući jugoistočnu Aziju i jugozapadnu Ameriku. Velike epidemije kuge rijetke su u modernom svijetu, a nijedna se nije dogodila u Sjedinjenim Državama od 1920-ih. Međutim, ovaj mikrob i dalje predstavlja prijetnju, zarazivši 1,000 do 2,000 ljudi godišnje i ubijajući otprilike jednog od sedam od njih.
Antibiotici su trenutno vrlo učinkoviti u borbi protiv infekcije Yersinia pastis, ali nedavna istraživanja sugeriraju da se otpornost može povećati. Bakterije su često sposobne međusobno razmjenjivati elemente DNK u divljini, a Yersinia pastis čini se da je uspjela steći gene koji proizvode otpornost na antibiotike razmjenom s drugim, mnogo češćim, bakterijama. Te su bakterije razvile otpornost na lijekove kao odgovor na raširenu upotrebu, čestu prekomjernu uporabu i zlouporabu antibiotika.