Kontrolor zračnog prometa mornarice odgovoran je za usmjeravanje i kontrolu zračnog prometa u blizini nosača zrakoplova ili pomorske baze. Obično kontrolor zračnog prometa u mornarici uspostavlja radio kontakt samo s vojnim pilotima, iako kontrolori mogu pokušati uspostaviti kontakt s civilnim pilotima koji zalutaju u pomorski zračni prostor. Poput civilnih kontrolora, vojni kontrolor mora završiti fakultetsku diplomu i proći opsežnu obuku na poslu.
Pomorske snage u mnogim zemljama koriste nosače zrakoplova za prevoz vojnih mlaznjaka i drugih zrakoplova na različita mjesta diljem svijeta. Piloti upravljaju tim letjelicama i ti su pojedinci odgovorni za presretanje neprijateljskih boraca i provođenje izvidničkih misija. Budući da mornarički piloti često provode misije u udaljenim oceanskim područjima, potrebni su kontrolori zračnog prometa na brodu kako bi usmjerili tijek zračnog prometa i osigurali da ne dođe do sudara u zraku. Osim toga, mnoge su pomorske operacije strogo povjerljive, u kojem slučaju vojska obično koristi pomorske kontrolore zračnog prometa, a ne civilne kontrolore, čak i ako mornarički piloti djeluju unutar komercijalnog zračnog prostora.
Nosači zrakoplova su stalno u pokretu što znači da se piloti oslanjaju na kontrolore zračnog prometa koji će ih voditi do ovih brodova nakon završetka misija. U usporedbi s aerodromima, pomorske fregate imaju relativno malo manevarskog prostora što znači da kontrolori moraju osigurati da su palube čiste prije nego što piloti dobiju dopuštenje za slijetanje. Kao i kod civilnih kontrolora, kontrolor zračnog prometa u mornarici također mora uzeti u obzir vremenske uvjete prije nego što pilotu da dozvolu za polijetanje ili slijetanje mornaričkog zrakoplova.
Tijekom konfliktnih situacija, kontrolor zračnog prometa mornarice nadzirat će zračni prostor oko broda ili pomorske baze kako bi pratio neprijateljske lovce koji mogu predstavljati prijetnju pomorskim snagama. Kontrolor mora upozoriti pomorske pilote na svaku takvu prijetnju. Obično je jedan kontroler dodijeljen svakom nosaču zrakoplova; kontrolori na brodovima koji rade u istim vodama moraju biti povezani jedni s drugima kako bi osigurali da se zrakoplovi s njihovih brodova ne sudare. U nekim okolnostima, kontrolori mornarice mogu također stupiti u kontakt s pilotima zračnih snaga ako druge vojne jedinice osiguravaju zračno pokrivanje pomorskih fregata.
Općenito, kontrolor zračnog prometa u mornarici mora završiti četverogodišnju diplomu iz zrakoplovnog inženjerstva ili slične teme. Kao i kod drugih pripadnika oružanih snaga, kontrolori moraju uspješno proći osnovnu obuku i u mnogim slučajevima ti pojedinci moraju provesti nekoliko mjeseci ili godina u pomorskim akademijama za obuku prije nego što se prijave za poslove kontrolora. Obično se samo službenici mogu prijaviti za mjesta kontrolora.