Računovođa sustava ima dvije glavne uloge u organizaciji. Ona najprije mora pregledati i ocijeniti sve financijske sustave, prakse i politike tvrtke. To određuje njihovu vrijednost i učinkovitost kao neovisnih entiteta i kao dijela cijele mreže sustava. Nakon ove analize, od nje se traži da eliminira sustave i prakse lošeg učinka te osmisli poboljšane sustave zamjene.
Uspjeh računovođe sustava uvelike ovisi o njezinoj kombiniranoj stručnosti u razumijevanju i primjeni koncepata informacijske tehnologije, računovodstva i financijskog upravljanja. Ova pozadina joj omogućuje učinkovitu analizu performansi sustava. Nakon evaluacije, ona obično priprema izvješća o svojim nalazima i distribuira ih odgovarajućem osoblju.
Odlučivanje koje sustave zamijeniti može biti zastrašujući zadatak. Računovođa sustava često se savjetuje s menadžerima i ključnim osobljem o prednostima i nedostacima njihovih specifičnih sustava prije nego što odluči kako dalje. Ovisno o veličini i utjecaju tvrtke, ona također može razgovarati o predloženim promjenama s vanjskim agencijama ili dobavljačima kako bi utvrdila učinke svojih odluka na njihove ciljeve i očekivanja. Njezin je cilj osigurati najučinkovitije, točne i najisplativije sustave.
Računovođa sustava mora pažljivo procijeniti mnoge aspekte financijskih sustava. Njihova dugoročna i kratkoročna učinkovitost je ključni čimbenik, kao i kako će promjene sustava utjecati na sve odjele tvrtke. Ako će jedan odjel trpjeti na račun poboljšanja operacija u drugom, od nje se traži da pažljivo odvagne što je dugoročno najbolje za oboje. Od računovođe se traži da prouči sve, od osnovnih značajki kontrole dokumenata do potrebne obuke krajnjih korisnika. Ostali čimbenici koje mora uzeti u obzir uključuju raspon zadataka koje sustav može izvršiti, evidenciju o kvarovima i zastojima te hoće li njegove značajke biti održive dovoljno dugo da opravdaju ulaganje.
Nakon donošenja odluka o promjenama i implementacije novih sustava, računovođa sustava stalno prati njihovu izvedbu i dobiva povratne informacije od odjela na koje se to odnosi. Zajedno s tim menadžerima, supervizorima i ključnim igračima, ona odlučuje koji su sustavi uspješni, a koji trebaju daljnji pregled, poboljšanja ili zamjenu.
Posao računovođe sustava obično se sastoji od mnogih tekućih projekata, budući da se odjeli razvijaju i njihovi sustavi zahtijevaju prilagodbe. Istodobno provodi redovite evaluacije rada kako bi osigurala da sve financijske i računovodstvene funkcije ostaju točne i učinkovite. Kako se tehnologija pojavljuje, od nje se očekuje da će prenijeti napredak odgovarajućem osoblju za njihove stručne povratne informacije i doprinos.
Budući da su odgovornosti računovođe sustava tako raznolike, često je potreban magisterij. U nekim slučajevima može biti prihvatljiva diploma iz računovodstva ili financija zajedno s dokazanim uspjehom u analizi sustava ili računalnih znanosti.