Bazalna tjelesna temperatura žene tijekom trudnoće ostaje blago povišena od trenutka začeća do otprilike kraja prvog tromjesečja. U većini slučajeva, ovo malo povećanje temperature mirovanja nije primjetno osim uz korištenje bazalnog termometra, koji može točno očitati tjelesnu temperaturu do 0.1°F (0.18°C). Mnoge žene koriste male fluktuacije bazalne tjelesne temperature kako bi odredile kada su najplodnije, a zatim kao rani pokazatelj trudnoće.
Iako postoje normalne fluktuacije bazalne tjelesne temperature, tijekom trudnoće ona je općenito između 0.4 i 1.0°F (0.072 i 0.18°C) viša nego između menstruacije i vremena ovulacije. Ako bazalna tjelesna temperatura žene ostane povišena više od 15 dana nakon ovulacije, to bi mogao biti rani pokazatelj da je trudna. Lažno negativni rezultati nisu neuobičajeni kod testova na trudnoću, ali stabilna, blago povišena temperatura od trenutka posljednje ovulacije tijekom dva ili više tjedana snažan je pokazatelj da je žena zatrudnjela. Tijekom tog vremena testovi na trudnoću često su nepouzdani, pa mnoge žene koriste ovu temperaturu kako bi utvrdile jesu li trudne ili ne.
Bazalna tjelesna temperatura ostat će na ovoj blago povišenoj razini tijekom prvog tromjesečja normalne trudnoće. Na kraju prvog tromjesečja, temperatura žene se vraća na normalu. Oštar porast vjerojatno je pokazatelj da se bori protiv infekcije ili bolesti.
Mnoge žene koriste bazalnu tjelesnu temperaturu kako bi im pomogle u određivanju ciklusa plodnosti. Temperatura je obično prilično dosljedna između kraja menstruacije i sljedeće ovulacije. Kako žena ovulira, bazalna tjelesna temperatura će pasti za nekoliko desetina stupnja, a zatim će naglo porasti, između 0.4 i 1°F (0.072 i 0.18°C). Temperatura će ostati povišena sve dok žena ne počne menstruaciju, a u tom trenutku ciklus počinje iznova. Ako je žena zatrudnjela, njena tjelesna temperatura treba ostati povišena, pa je smanjenje te temperature snažan pokazatelj da nije zatrudnjela tijekom određenog ciklusa ovulacije.