Postupak biopsije koristi se za uklanjanje sumnjivog materijala za pregled. Za ljude koji prije nisu radili biopsiju, može biti pomalo alarmantno čuti da je ona zatražena. Poznavanje pojedinosti o tome što očekivati može učiniti da se ljudi osjećaju spremnije, omogućujući im da se opuste za postupak kako bi on prošao glatko. U svim slučajevima o rezultatima biopsije treba razgovarati s liječnikom kako bi se osiguralo da pacijent zna što rezultati znače i kakav odgovor treba poduzeti.
Prije nego što se izvrši biopsija, liječnik mora utvrditi da je pacijentu potrebna. Fizikalni pregled može otkriti područje zabrinutosti, kao što je komadić kože koji je promijenio boju ili kvržica u mekom tkivu. Biopsija se također može zatražiti ako medicinska slikovna studija otkrije nepravilnost ili ako bi biopsija pomogla liječniku u postavljanju dijagnoze.
Prvi korak u postupku biopsije je priprema mjesta i pacijenta. Mjesto se obično obriše i opere tako da bude sterilno, a na područjima gdje ima dlačica, mjesto se može obrijati. Zatim se ubrizgava lokalni anestetik kako pacijent ne bi osjetio bol. U nekim slučajevima, pacijentu se može ponuditi lijek protiv anksioznosti za opuštanje za biopsiju. Za određene biopsije, pacijent se može staviti pod opću anesteziju.
U biopsijama gdje je pacijent anesteziran, anestezija se koristi u svrhu kirurške biopsije, u kojoj liječnik zasijeca tijelo kako bi uklonio uzorak iz područja interesa. Ova tehnika je rjeđa s pojavom nekoliko vrsta biopsije iglom, u rasponu od aspiracije finom iglom do biopsije potpomognute vakuumom, u kojoj se velika igla uvodi u područje interesa i koristi se za vađenje uzorka iz bolesnika pri svijesti. Ako je područje koje se biopsira nalazi na koži, skalpel će se koristiti za struganje uzorka.
Biopsija se može uzeti uz pomoć medicinskog snimanja kao što je ultrazvuk. Medicinska slika se koristi za ispravnu identifikaciju područja interesa kako bi se uzorak uzeo s pravog mjesta. U biopsiji vođenoj žicom, slika se koristi dok se postavljaju fine žice za označavanje područja koje treba biopsirati, a kirurg koristi žice kao vodič za kiruršku biopsiju. Neki zahvati mogu zahtijevati upotrebu endoskopskih sondi koje se umetnu u tijelo za generiranje slike, omogućujući liječniku da jasno vidi mjesto koje je potrebno biopsirati.
Ako je pacijent pri svijesti, morat će ostati vrlo miran tijekom postupka biopsije, a možda će biti potrebno zauzeti određeni položaj. Biopsija ne bi trebala biti bolna zbog lokalnog anestetika, ali može biti neugodna. Osobito u slučajevima kada se koriste sonde, nelagoda je uobičajena za svjesne pacijente, kao na primjer kod endoskopske biopsije jednjaka.
U slučaju kirurške biopsije, kirurg će zatvoriti mjesto i previti ga, dajući pacijentu upute za naknadnu njegu. Biopsije igle i površinske biopsije mogu lagano curiti, pa su obično prekrivene laganim zavojima, a od pacijenta se može tražiti da bude oprezan oko mjesta dok zacjeljuje.
Nakon uzimanja uzorka u postupku biopsije, može se pregledati u laboratoriju od strane patologa, koji će napisati izvješće o uočenom. Može potrajati samo nekoliko sati da se dobiju rezultati biopsije u nekim slučajevima, dok u drugim slučajevima može potrajati danima, jer uzorak može zahtijevati poseban tretman ili ga treba poslati u laboratorij u drugom području.