Arheje su glavna skupina prokariota, jednostaničnih organizama bez jezgre. U sustavu klasifikacije s tri domene koji je uveo Carl Woese 1990., one su jedna od tri skupine, zajedno s bakterijama i eukariotama. Kada su prvi put otkrivene, u ekstremnim okruženjima poput toplih izvora u parku Yellowstone, arheje su pogrešno kategorizirane kao bakterije i nazvane su arhebakterije. Ponekad se organizmi u ovoj skupini još uvijek nazivaju arhebakterijama, iako je ovaj termin nestao jer nisu bakterije. Unatoč tome, mnogi imaju sufiks – bakterije uključen u naziv njihove vrste, što je ostatak iz vremena kada se smatralo da su bakterije.
Vjerojatno među prvim živim bićima na Zemlji, Archaea se čini da potječe iz arhejske ere, prije 3800 – 2500 milijuna godina. Njihovo ime na grčkom znači “stari”. Iako su prokarioti poput bakterija, bliži su srodnicima eukariota kao što je ameba. Arheje su prvo pronađene samo u malim količinama u ekstremnim okruženjima, ali su od tada pronađene na mnogim drugim mjestima i mogu činiti 20% planetarne biomase.
Arheje su dobro poznate po tome što su ekstremofili, i uspjele bi u teškim uvjetima na ranoj Zemlji, prije više milijardi godina. Teško je zamisliti planetarnu katastrofu koja bi mogla uništiti sve te organizme. Tri glavne skupine su halofili (ljubitelji soli), termofili (ljubitelji topline) i acidofili (ljubitelji kiseline).
Halofili, kao što je Halobacterium, mogu preživjeti u vodi pet puta slanijoj od oceana, a nalaze se u velikom broju na mjestima poput Velikog slanog jezera, Mrtvog mora i jezera Magadi u Keniji. Termofili, kao što je Thermus aquaticus, uspijevaju na temperaturama iznad 113°F (45°C), koristeći jedinstvene enzime koji djeluju samo pri tako visokim temperaturama. Hipertermofili su vrsta arheja kojima su za razmnožavanje potrebne još više temperature. Zloglasni soj 121, izvađen iz dubokog morskog hidrotermalnog otvora uz obalu države Washington, može preživjeti i razmnožavati se na temperaturama od 250°F (121°C), temperaturi autoklava. Acidofili poput Acidianus infernus preživljavaju u vodi s pH ispod 2, otprilike jednako kiseloj kao želučana kiselina.