Bakterijske spore iznimno su otporne kopije genetskog materijala koji bakterije mogu koristiti za preživljavanje u teškim uvjetima. Dopuštaju organizmima da uđu u stanje mirovanja kada su izloženi neprijateljskom okruženju. Nakon što pritisci iz okoline padnu, spore se mogu aktivirati, omogućujući bakterijama da se ponovno počnu razmnožavati. Nisu sve bakterije sposobne stvarati spore, ali neki dobro poznati patogeni poput antraksa, tetanusa i botulizma mogu, što ih čini predmetom interesa i brige medicinskih istraživača.
Organizmi mogu početi stvarati spore kao odgovor na specifične pritiske okoline, kao što je pad opskrbe vodom, porast temperature ili zračenje. Potrebno je nekoliko sati da se formiraju bakterijske spore i cijele kolonije ne mogu preživjeti ove uvjete, ali neke jake jedinke mogu biti u stanju sporulirati na vrijeme kako bi se zaštitile. Organizmi prave kopiju svog genetskog materijala i zarobljavaju ga unutar čvrste kapsule unutar stanične membrane. Više slojeva materijala okružuje sporu, povećavajući šanse za preživljavanje.
Zračenje, visoka toplina i ekstremna suhoća ne oštećuju spore bakterija. Također se opiru liječenju baktericidima. To može predstavljati značajnu prijetnju ljudskom zdravlju i sigurnosti u slučaju patogenih organizama, jer oni mogu preživjeti većinu mjera koje se koriste za smanjenje infekcije. Brisanje površina baktericidnim sapunima, na primjer, može ostaviti bakterijske spore netaknute. Isto tako, zračenje prehrambenih proizvoda ne bi uništilo spore.
Kako bi se ubile spore, obično je potrebno osigurati produljeni sadržaj s kemijskim spojem koji može napasti bakterijske stanične stijenke i uništiti genetski materijal unutar. 10% otopina izbjeljivača, ako se ostavi u kontaktu sa sporama bakterija najmanje pet minuta, može biti učinkovita metoda dekontaminacije. Neke spore mogu preživjeti čak i izvan ovog prozora, što ilustrira otpornost ovih struktura. Dodavanje stvaranja spora u njihov životni ciklus omogućilo je brojnim organizmima da izdrže vrlo teške uvjete okoliša koji bi bili preoštri za druge organizme.
Istraživanje spora ispituje kako nastaju i kako se s njima može riješiti ako ih stvaraju organizmi za koje je poznato da uzrokuju bolest. To zahtijeva pažljivo kontrolirana okruženja kako bi se pokrenulo stvaranje spora i izložile spore različitim opasnostima. To može pomoći istraživanju da se utvrdi što će pouzdano ubiti bakterijske spore kako bi mogli dati preporuke protokola infekcije. Proizvođači baktericida za okruženja poput bolnica i istraživačkih ustanova također moraju ostati korak ispred svojih ciljeva, jer su ti organizmi vrlo prilagodljivi i mogu razviti otpornost na otopine za čišćenje tijekom vremena.