Gusti i kolačasti, muffini od pšeničnih mekinja obično koriste integralno pšenično brašno s dodatkom pšeničnih mekinja i pšeničnih klica. Ova dva sastojka prisutna su u pšenici u malim količinama; međutim, u muffine od pšeničnih mekinja dodaje se velika količina i pšeničnih mekinja i pšeničnih klica radi povećanja nutritivnog sadržaja. Budući da pšenične mekinje mogu biti prilično suhe, najvjerojatnije zbog visokog sadržaja vlakana, u recept se dodaje velika količina tekućine koja osigurava vlagu. Muffini od čistih pšeničnih mekinja možda neće uključivati pšenične klice u receptu, a mogu zahtijevati dodatke poput sušene jabuke, cimeta i đumbira za dodatni okus.
Pšenične mekinje sastavni su dio cijelog zrna pšenice i sadrže veliku količinu vlakana, kao i druge hranjive tvari poput proteina, kalcija i željeza. Mnogo puta se ovaj sastojak dodaje receptima za zdrave muffine kako bi se povećao sadržaj hranjivih tvari, kao i za stvaranje težih, gušćih muffina ili kolača. Češće nego ne, još jedna komponenta koja se zove pšenične klice dodaje se u muffine od pšeničnih mekinja, povećavajući sadržaj hranjivih tvari u receptu. Ne sadrže svi recepti pšenične klice, ali većina će dodati ovaj sastojak kako bi uravnotežila okus mekinja.
Budući da se u većini muffina s mekinjama koristi cijelo pšenično brašno, većina recepata zahtijeva veliku količinu tekućine kako bi se spriječilo da tijesto postane pregusto. Dodavanje jogurta, otopljenog maslaca ili ulja, kao i jaja i mlijeka uobičajeno je kako bi se spriječilo da muffin nakon pečenja postane pretvrd ili gust. Iako će konačni proizvod biti teži od tradicionalnih muffina napravljenih od čistog bijelog ili pšeničnog brašna, muffini od pšeničnih mekinja i dalje će sadržavati malo vlage i lakoće.
Uobičajeni dodaci sastojaka muffinima od pšeničnih mekinja uključuju sušenu jabuku, cimet i đumbir kako bi dodali okus i složenost pečenom proizvodu. Postoje mnoge poznate zdravstvene prednosti pšeničnih mekinja koje se nalaze u muffinima s mekinjama, od kojih većina potječe od vlakana prisutnih u komponenti žitarica. Mnogi stručnjaci za prehranu vjeruju da velika količina vlakana u muffinima s mekinjama može promicati redovitost i zdravo debelo crijevo. Cijela pšenica i njezine komponente, poput pšeničnih klica i pšeničnih mekinja, također su se pokazale korisnima u regulaciji šećera u krvi usporavajući apsorpciju glukoze u krv.