Organska jaja su jaja koja proizvode kokoši koje se hrane posebnom organskom hranom. Definicija organskog proizvoda ovisi o agenciji koja ga definira, a to se može razlikovati od mjesta do mjesta. Može se reći da većina organskih jaja obično dolazi od pilića kojima se ne daju hormoni, ne dobivaju rutinski profilaktički antibiotici (kako bi spriječili infekciju) i koji jedu hranu koja je organski uzgojena. To znači da hrana koju jedu obično nije tretirana kemijskim pesticidima ili gnojivima.
Mogu postojati i drugi zahtjevi da se jaja smatraju organskim. Mnoga organski položena jaja također dolaze od kokoši koje nisu ograničene na mali kavez. Ovim kokošima, koji se nazivaju slobodnim uzgojem, dopušteno je da lutaju i mogu imati dnevni pristup otvorenom. Međutim, kokoši u slobodnom uzgoju ne proizvode uvijek organska jaja. Oni su svakako tržište i za jaja iz slobodnog uzgoja i za organska jaja, a praksa uzgoja pilića koji će odgovarati objema kvalifikacijama brzo raste.
Kupci u trgovini primijetit će povećanu cijenu organskih jaja, pa čak i onih s oznakom slobodnog uzgoja. To je zato što će kokoši koje nisu hranjene hormonima prirodno proizvesti manje jaja, a kokoši iz slobodnog uzgoja mogu poneti nešto jaja na zemlju, koja se u nekim zemljama možda neće legalno prodavati. Također, za kokoši iz slobodnog uzgoja, što može biti dio ekološke definicije u nekim zemljama, potrebno je više prostora za smještaj manjeg broja životinja. Stoga je proizvodnja jaja obično niža, a cijena organske hrane također ulazi u jednadžbu, budući da je skuplja od hrane koja se uzgaja koja ne zadovoljava ekološke standarde.
Oni koji su zagovornici metoda organskog uzgoja smatraju da se malo povećanje cijene isplati za dobivanje organskih jaja. Na primjer, mnogi tvrde da, budući da se organski pilići mogu u potpunosti hraniti žitaricama, iako to nije uvijek slučaj, one proizvode jaja s nižim sadržajem masti, a broj željeza u žumanjcima organski proizvedenih jaja može biti veći. Drugi uobičajeni argument je da organskim jajima nedostaju neke od kemikalija prisutnih u jajima proizvedenim na drugi način, te da je nemoguće procijeniti štetu redovitog konzumiranja ostataka pesticida, hormona i antibiotika. Osim toga, kada neslanice iz slobodnog uzgoja proizvode ova jaja, mnogi tvrde da se takve životinje uzgajaju na način potpuno bez okrutnosti.
S ovom posljednjom točkom ne slažu se aktivisti za prava životinja, poput onih koji pripadaju People for Ethical Treatment of Animals (PETA). PETA tvrdi da organski uzgoj možda neće osigurati uzgoj bez okrutnosti, osobito u SAD-u, te da čak i jaja iz slobodnog uzgoja ne moraju značiti da kokoši lutaju bez brige u svijetu. Organizacije poput PETA-e smatraju da ove oznake ostavljaju previše rupa u zakonu koje uzgajivači životinja još uvijek mogu zloupotrijebiti i da varaju potrošače da misle da ne podržavaju okrutnost prema životinjama, kada to možda nije slučaj.