Vjerojatno najčešći uzrok boli u bubrezima je infekcija bubrega, poznata kao pijelonefritis, gdje se tupa, bolna bol u gornjem dijelu leđa javlja s jedne strane, oko razine najnižih rebara, zajedno sa simptomima kao što su groznica i krv u mokraći. Bubrežni kamenci mogu uzrokovati jaku i iznenadnu bol, međutim, budući da se to događa kada kamen napusti bubreg i kreće se duž cijevi ili mokraćovoda, koji vodi do mokraćnog mjehura, moglo bi se tvrditi da to tehnički nije bubrežna bol. Važno je zapamtiti da neka stanja koja su dovoljno ozbiljna da prouzrokuju zatajenje bubrega ne dovode do boli i da se čini da bol dolazi iz bubrega, ali druge bolesti mogu uzrokovati bol u istom području. Ponekad ljudi pretpostavljaju da je bol u donjem dijelu leđa bol u bubrezima, ali bubrezi su smješteni nešto više, uvučeni unutar donjih rebara na stražnjoj strani torza. Drugi mogući uzroci boli u bubrezima uključuju krvne ugruške, tumore, infekciju mokraćnog sustava i bilo koju bolest bubrega koja rezultira smrću bubrežnog tkiva.
Stanje poznato kao ateroskleroza, gdje se arterije sužavaju, može dovesti do stvaranja krvnog ugruška u bubrežnoj arteriji koja opskrbljuje bubreg. Gubitak opskrbe krvlju nekog ili cijelog bubrežnog tkiva uzrokuje iznenadnu bol i vjerojatno krv u mokraći. Tumori bubrega također mogu uzrokovati krv u mokraći, ali bol zbog tumora obično se razvija postupnije. Hidronefroza je još jedno stanje koje može uzrokovati bol u bubrezima. Kod hidronefroze, opstrukcija protoka mokraće iz bubrega tumorom, kamencem ili pregibom u mokraćnom traktu dovodi do povratnog pritiska urina i natečenog bubrega.
Dijagnoza boli u bubrezima može se provesti pomoću testova kao što su štapići za mjerenje urina i urinokulture. Štapići za mjerenje urina mijenjaju boju kako bi ukazali na abnormalnosti u mokraći, kao što su promjene u kiselosti i koncentraciji, ili prisutnost krvi, proteina, bakterija i drugih tvari. Infekcija bubrega mogla bi dovesti do otkrivanja krvi i proteina u mokraći, a urinokultura, u kojoj se mikrobi iz uzorka urina mogu razmnožavati, mogla bi se koristiti za određivanje vrste bakterija koje su uključene.
X-zrake i skeniranje bubrega i mokraćnog sustava mogu pomoći u dijagnosticiranju uzroka boli u bubrezima. Uzorak bubrežnog tkiva, poznat kao biopsija, može se uzeti za traženje znakova bolesti. Neki bubrežni poremećaji, kao što je policistična bolest bubrega, uzrokuju visoki krvni tlak, kao i bol, a krvni tlak se može mjeriti tijekom pretraga. Mogu se poduzeti krvne pretrage kako bi se provjerilo nakupljaju li se otpadni proizvodi u krvi zbog gubitka funkcije bubrega. Liječenje boli u bubrezima varira ovisno o uzroku, ali najčešće bol nestaje kada se uspješno liječi temeljno stanje.