Postoje nedoumice u vezi s trudnoćom i čepićima, ali one se mogu ublažiti uzimanjem čepića samo umjereno i samo pod vodstvom liječnika. Najčešći čepići koji se daju tijekom trudnoće su glicerin za liječenje teške konstipacije i progesteron za održavanje zdrave razine hormona. Ako se bilo koji od ovih pretjera, trudnoća može biti ugrožena. Postoje i kontraindikacije ako se jedan lijek uzima istodobno s drugim. Zbog toga sve lijekove za trudnice, bilo da su čepići ili drugi oblici, mora propisati medicinski stručnjak.
Zatvor je uobičajeno stanje za trudnice i može doseći vrlo neugodne i bolne razine. Vrlo često, dodaci željeza koji se prepisuju tijekom rane trudnoće mogu biti odgovorni za stanje ili to može biti posljedica prehrane bez vlakana. To može biti i zbog hormonalnih promjena koje se događaju u ženskom tijelu. U početku, liječnici mogu savjetovati da se na neko vrijeme isključi željezo ili promijeni vrsta dodatka dok se stanje ne olakša ili mogu predložiti načine za povećanje količine vlakana i tekućine u prehrani. Ako niti jedna od ovih metoda ne djeluje, tada se mogu propisati glicerinski čepići. Postoji zabrinutost u vezi s propisivanjem čepića za zatvor da, iako nisu zabilježeni štetni učinci, tretmani se ne smatraju idealnim za bilo što osim za kratkotrajnu upotrebu u krajnjoj nuždi.
Progesteron je hormon koji igra ključnu ulogu u održavanju zdrave trudnoće. Ako razina progesterona padne, nešto što se češće događa u ranoj trudnoći, postoji znatan rizik za trudnoću i čepići koji sadrže progesteron mogu se smatrati potrebnim. Nakon uporabe čepića mogu se pojaviti neke nuspojave koje uključuju povraćanje, glavobolje, bolove u trbuhu i mučninu. Poput glicerinskih čepića, progesteron treba smatrati samo kratkoročnim rješenjem jer dugotrajna uporaba može dovesti do vaginalnog krvarenja i infekcija mokraćnog sustava.
Budući da postoje kontraindikacije između lijekova koji mogu naštetiti majci ili bebi, treba biti oprezan s upotrebom bilo kojeg lijeka tijekom trudnoće, a čepići su jednako vjerojatno da će uzrokovati štetu kao i svaki drugi lijek. Tijekom trudnoće treba uzimati lijekove samo kada se smatra da su koristi veće od rizika. Brige oko trudnoće i čepića ne razlikuju se od zabrinutosti oko trudnoće i bilo kakvih lijekova. Čak i alternativne biljke i čajeve treba pažljivo provjeravati jer bi i oni mogli negativno utjecati na dijete u razvoju.