Košer meso obično je skuplje od mesa koje nije certificirano kao košer jer zahtijeva posebno rukovanje. Kao i drugi specijalizirani prehrambeni proizvodi, košer meso zahtijeva pažnju obučenih i iskusnih stručnjaka, a također mu je potrebna pažnja vjerskog službenika koji može potvrditi da je meso u skladu sa židovskim zakonom o prehrani ili kašrutom. Pravila oko mesa u židovskoj tradiciji prilično su složena i vrlo specifična.
Jedan problem s košer mesom je da čak i kada je životinja iz vrste koja se može jesti, njeno meso ne mora nužno biti košer. Nakon što su životinje zaklane, moraju se pregledati kako bi se potvrdilo da nemaju bolesti ili ozljede. Ako je životinja ozlijeđena ili bolesna, meso je treif, i ne može se jesti, čak i ako bi meso prošlo inspekciju sigurnosti hrane. U židovskoj zajednici također se vodi neka rasprava o glatt košer mesu; u nekim židovskim zajednicama, posebno pluća moraju biti bez nedostataka kako bi se meso moglo certificirati kao glatt, što zahtijeva da životinja ispunjava dodatne standarde.
Sam košer mesar, poznat kao shechita, također je pomalo složen. Treba ga izvesti pripadnik židovske vjere koji je osposobljen za izvođenje postupka, pobožan je i koji poštuje život životinje koja se kolje. Također se mora izvesti na određeni način, prerezanjem grla dok je životinja pri svijesti, s tim da se meso rukuje tako da se potpuno ocijedi od krvi. Shochet ili ritualni klaonik mora naučiti niz strogih kodeksa prije nego što izvrši ritualno klanje.
Određene vrste mesa mogu zahtijevati posebno rukovanje. Na primjer, neke posjekotine moraju biti podvrgnute porgingu, u kojem se uklanjaju tetive, vene i masnoća. Umjesto da jedu te komade, neke košer klaonice odlučuju prodati meso ne-košer tržištu, što može otežati nabavku tih rezova kada su ljudima potrebni.
Posebno rukovanje, potreba da se košer meso drži odvojeno od onog koje nije košer, i posebna obuka potrebna ljudima koji rade s košer mesom povećavaju troškove. Za pobožne Židove koji se žele pridržavati zakona o prehrani, ovaj se trošak smatra prihvaćanjem u zamjenu za jamstvo da je meso pravilno obrađeno i pripremljeno. Košer meso nije nužno bolje kvalitete, pa se manje vjerni Židovi i pogani mogu odlučiti za kupnju običnog mesa ako je dostupno.