Citoplazmatsko bojenje nastaje kada tekućina sadržana u stanici promijeni boju. To se događa iz jednog od dva razloga: ili zato što je stanica na neki način postala manjkava ili zato što je obojena za potrebe znanstvene analize. Virusi poput citomegalovirusa i karcinomi poput hepatocelularnog karcinoma mogu uzrokovati granulirano bojenje citoplazme. Znanstvenici boje citoplazmu kako bi stvorili kontrast boja kada proučavaju određene elemente stanice.
Citoplazma je viskozna tekućina koja se nalazi unutar stanične membrane. To je obilježje i prokariotskih i eukariotskih stanica. Citoplazma u prokariotskoj stanici sadrži sav genetski materijal stanice, proteine i druge materijale. U eukariotskoj stanici mnoge se stanične funkcije izvode unutar samostalnih organela. Gotovo 70 posto citoplazme eukariotske stanice sastoji se od citosola, stvarne tekućine, koja uglavnom sadrži vodu, sol i topive molekule kao što su proteini, lipidi i ugljikohidrati.
Citomegalovirus (CMV) je vrsta herpesvirusa koji može zaraziti ljude kao i druge organizme i jedan je primjer stanja koje može uzrokovati citoplazmatsko bojenje. Ljudska varijanta, HCMV, uzrokuje ogromnu štetu samo pacijentima s potisnutim imunološkim sustavom kao što su oni s virusom humane imunodeficijencije (HIV). Citoplazmatsko bojenje javlja se u malom broju stanica zahvaćenih CMV-om. Studije su dokazale da je citoplazmatsko bojenje stanica inficiranih CMV-om nasumično i nije dijagnostičko.
Znanstveno citoplazmatsko bojenje događa se kada se u citoplazmu doda boja specifična za klasu. Umjesto bojenja cijele citoplazme ili citosola, boja cilja na određene njene elemente kao što su organele, proteini ili deoksiribonukleinska kiselina (DNK). Boja se primjenjuje ili kada je stanica živa (in vivo) ili kada je stanica mrtva (in vitro). Uzorci se nakon bojenja proučavaju mikroskopom.
Proces bojenja varira ovisno o tome što se cilja i zašto. Istraživački laboratoriji obično imaju protokole za bojenje svake vrste stanica. Na primjer, istraživanje bojanja stanica tijekom hepatocelularnog karcinoma zahtijeva imunokemijsko bojenje kao svoju poželjnu metodu citoplazmatskog bojanja kako bi se proučio odgovor tijela na karcinom. Ovaj proces uključuje deparafinizaciju, ispiranje vodikovim peroksidom i zagrijavanje uzorka u otopini za vađenje antigena.
Hepatocelularni karcinom je relativno čest oblik malignog raka kod ljudi. Riječ je o raku koji prvenstveno zahvaća jetru, a svake godine u Sjedinjenim Državama ima otprilike 16,000 novih slučajeva raka. Znanstvenici su razvili boju ili tvornicu, nazvanu Thyroid Transscription Factor-1 (TTF), kako bi razlikovali primarne stanice raka od opasnijih metastatskih stanica raka.