Razlika između sintakse i morfologije je u tome što se sintaksa bavi strukturom rečenica, a morfologija strukturom riječi. U svakom jeziku postoje pravila koja vode način na koji se riječi sastavljaju. Ovo su pravila sintakse. Morfologija je studija o tome kako se riječi formiraju i razumiju unutar jezika. I sintaksa i morfologija povezane su s načinom na koji se značenje proizvodi jezikom.
Sintaksa je koncept koji upravlja strukturom rečenica. Redoslijed slaganja riječi utječe na značenje rečenice u cjelini. Moraju se poštovati pravila sintakse kako bi rečenica bila gramatički ispravna i imala smisla za govornike jezika. To je ono što diktira stvari kao što su redoslijed subjekta i glagola te kako se koriste pridjevi i prilozi.
Morfologija je proučavanje morfema, koji su najmanja jedinica značenja u jeziku. Morfem može biti jedna cijela riječ ili prefiks ili sufiks za koji se razumije da mijenja značenje riječi i stoga poprima samo značenje. Morfologija uključuje koncepte fleksije i derivacije, koji omogućuju da riječi budu u množini ili da se promijeni vrijeme riječi. Studij morfologije pokušava razumjeti kako ljudi koriste i razumiju način na koji te riječi rade, u pokušaju razumjeti razliku koju jedan morfem čini mnogim riječima i kako se riječi međusobno odnose.
Sintaksa i morfologija važne su za način na koji ljudi izvode značenje iz jezika, ali se razlikuju po tome što se sintaksa odnosi na redoslijed i upotrebu riječi, a morfologija se odnosi na dijelove riječi koji stvaraju značenje. Na primjer, moguće je stvoriti rečenicu koja je gramatički ispravna, ali koja govorniku jezika nema smisla. To je moguće jer sintaksa upravlja samo redoslijedom rečenice, a ne značenjem riječi u njoj. S druge strane, kombinacija riječi može imati smisla kada se koristi zajedno, ali gubi svoje značenje kada se prerasporedi na način koji krši pravila sintakse. Sintaksa i morfologija su različite, ali ovise jedna o drugoj.