Transplantacija matičnih stanica za multipli mijelom može produžiti život nekim pacijentima. S druge strane, postupak spašavanja života može imati ozbiljne komplikacije uključujući sekundarne karcinome, neuspjeh transplantata, pa čak i smrt. Umjerene reakcije uključuju krvarenje i infekcije, dok se mogu javiti i manje ozbiljne komplikacije poput neplodnosti i katarakte.
Iako transplantacija matičnih stanica za multipli mijelom nije lijek, pacijenti koji se podvrgnu zahvatu često mogu usporiti napredovanje bolesti. Nakon uspješnog zahvata, kod nekih pacijenata često dolazi do povlačenja simptoma i progresije bolesti. Pacijenti s višestrukim mijelomom mogu birati između autologne i alogene transplantacije matičnih stanica. Autologna transplantacija matičnih stanica uključuje prikupljanje pacijentovih vlastitih matičnih stanica, dok alogene transplantacije matičnih stanica prikupljaju matične stanice bliskog darivatelja.
Proces transplantacije matičnih stanica donosi mogućnost produljenog života, ali postupak nosi i ozbiljan rizik. U konačnici, svaki pacijent će imati različite reakcije u rasponu od manjih do vrlo ozbiljnih nuspojava. Poznato je da se neplodnost i katarakta javljaju u bolesnika s multiplim mijelomom nakon ozračivanja cijelog tijela, koje se javlja prije tretmana matičnim stanicama. U slučaju neplodnosti, za ovulaciju će biti neophodna hormonska nadomjesna terapija. Oni koji primaju steroide u kombinaciji s transplantacijom matičnih stanica imaju veće šanse za razvoj katarakte.
Abnormalno krvarenje ili trombocitopenija i infekcije potencijalno su ozbiljne komplikacije transplantacije matičnih stanica za multipli mijelom. Trombocitopenija je nizak broj trombocita u krvi. Stanje može dovesti do prekomjernog krvarenja i modrica. Oportunističke infekcije također predstavljaju umjereni do ozbiljan rizik za dobrobit i oporavak bolesnika, osobito ako se uzimaju imunosupresivni lijekovi. Bakterijske infekcije liječe se snažnim antibioticima, dok se gljivične infekcije liječe antifungalnim lijekovima kao što je flukonazol.
Daleko ozbiljnije posljedice transplantacije matičnih stanica uključuju sekundarne karcinome poput leukemije i limfoma, osobito one koji se javljaju kod nekih pacijenata s multiplim mijelomom koji su primali kemoterapiju i zračenje prije transplantacije matičnih stanica. Neuspjeh presatka i bolest presatka protiv domaćina (GVHD) dvije su komplikacije opasne po život koje mogu dovesti do zatajenja organa, pa čak i smrti. U slučaju neuspjeha presatka, matične stanice ne uspijevaju rasti, što rezultira zatajenjem koštane srži. GVHD uključuje transplantirane matične stanice darivatelja za napad na primateljevo tjelesno tkivo. Primatelji alogenske transplantacije izloženi su većem riziku od razvoja akutnih i kroničnih oblika GVHD-a od onih koji primaju autolognu transplantaciju matičnih stanica za multipli mijelom.