Bol je jedna od najtežih riječi za definiranje. Može dolaziti s mnogim osjećajima – bolom, pečenjem, trganjem, ubodom – i u različitim stupnjevima ozbiljnosti, ali jedna karakteristika s kojom se svi mogu složiti je da je bol neugodna. U mnogim slučajevima može se barem dobro nagađati o izvoru boli. Lokalizacija nekih vrsta poput bolova u zglobovima, međutim, može otežati identifikaciju. Nadalje, mnoga stanja uzrokuju generaliziranu vrstu boli koja se u početku može činiti neprepoznatljivom. Bolesti koje mogu uzrokovati neobjašnjivu bol uključuju disfunkciju živaca, autoimuni poremećaj, nedostatke hranjivih tvari i somatoformnu bol ili druge psihološke izvore.
Upalne bolesti, osobito oko kostiju i zglobova, mogu uzrokovati oticanje i iritaciju. Budući da se ove bolesti javljaju unutar tijela, bol se u početku može činiti neobjašnjivom. Takva je upala često posljedica manje ozljede ili infekcije. Pridruženi bolovi mogu se širiti duž kostiju, što otežava lociranje izvora boli, što dovodi do naizgled neobjašnjive boli.
Određeni poremećaji poput autoimunih bolesti i raka također mogu opustošiti osjetljive unutarnje strukture. U prvom slučaju, stanja kao što je lupus otežavaju obrambenim bijelim krvnim stanicama tijela da razlikuju štetne tvari i normalna tjelesna tkiva. Kao rezultat toga, imunološki sustav zapravo napada tijelo, što će vjerojatno rezultirati bolom. Stanice raka imaju sličan štetni učinak na zdrava tkiva, osobito kada se bolest širi i zahvaća različite dijelove tijela. Sve, od žlijezda do krvnih žila, može biti ciljano u ovim ozbiljnim stanjima, a za tijelo se stvara čitav niz komplikacija, uključujući neobjašnjivu bol.
Drugi glavni izvor boli u odsutnosti očitog uzroka je neispravan rad živaca. Živčani završeci mogu preskočiti paljenje i uzrokovati naknadne trnce ili peckanje. Ove periodične nelagode mogu se pojaviti bilo gdje na tijelu i pogoršati se noću ili dodirom. Temeljna stanja kao što su dijabetes, celijakija i autoimuni poremećaji mogu dovesti do oštećenja živaca. U nekim slučajevima točni uzroci ovih stanja nisu poznati.
Uskraćivanje esencijalnih hranjivih tvari tijelu također može oslabiti različita područja, što dovodi do naizgled neobjašnjive boli. Nedostatak vitamina D, na primjer, može učiniti kosti lomljivima i osjetljivijima na trošenje i povezane bolove. Drugi nedostaci mogu utjecati na mišiće i kožu.
Jedan od najtajanstvenijih i najzaposlenijih organa u tijelu, mozak, u konačnici je odgovoran za svu bol, bilo da je ona objašnjena ili neobjašnjiva. Ovaj organ šalje i prima signale koje tijelo prepoznaje kao bol. Ponekad mozak može poslati ove signale slučajno, iako je točan razlog za ovaj odgovor uglavnom misterij. Fibromijalgija je jedno stanje za koje se vjeruje da je dijelom uzrokovano osjetljivim receptorima boli u mozgu, a karakterizira ga ekstremni umor i bol nakon pritiska. Osim toga, određeni psihološki čimbenici poput stresa i depresije mogu promijeniti kemiju mozga i doprinijeti bolovima, bolovima i općenito lošem osjećaju.