Biološki rat, koji se također naziva i rat protiv klica, je korištenje štetnih mikroorganizama kao što su virusi ili bakterije od strane vojnih frakcija ili terorista protiv civila, protivničkih snaga, usjeva ili životinja. Organizmi koji se koriste mogu djelovati tako što proizvode štetne otrove ili toksine prije ili nakon otpreme. Možda neće biti potrebno osloboditi veliku količinu biološkog oružja, budući da neke vrste smrtonosnih agenasa imaju potencijal ubiti čak i milijune ljudi ispuštanjem samo u tragovima.
Biološki rat može se koristiti na nekoliko različitih načina od strane vojne opreme ili drugih ljudi sa štetnim namjerama. Najčešća percepcija upotrebe bioloških agenasa je da su oni namijenjeni ubijanju velikih količina vojnika i civila, ali postoji mnogo načina na koje se mogu upotrijebiti. Manje štetne klice mogle bi se eventualno distribuirati među neprijateljskim vojnicima kako bi bili previše bolesni za borbu. Druga učinkovita upotreba mikroorganizama je njihova upotreba za ubijanje ili oštećenje neprijateljskih usjeva hrane u svrhu prekida njihove opskrbe hranom, a to može uključivati stoku, kao i glavne osnovne prehrambene namirnice biljnog podrijetla.
Godine 1969. u Sjedinjenim Državama, bivši američki predsjednik Richard M. Nixon izjavio je da zemlja više neće koristiti biološki rat protiv drugih zemalja. Ova vrsta borbi zabranjena je međunarodnim ugovorom 1975. godine, a uključuje i posjedovanje i proizvodnju biološkog oružja. Međutim, vojni stratezi i dan danas moraju voditi računa o mogućoj nezakonitoj upotrebi biološkog ratovanja od strane neprijatelja. Iz tog razloga u cijelom znanstvenom svijetu postoje stalna istraživanja koja su posvećena obrani od mnoštva scenarija bioloških napada. To uključuje terorističke napade, koji se također nazivaju bioterorizmom, koji se potencijalno mogu dogoditi bilo gdje u bilo koje vrijeme.
Da bi biološko oružje bilo učinkovito, mora biti sposobno putovati brzo i širokim područjem. Mora biti i teško popraviti. Na primjer, ako se radi o bolesti, cjepivo mora biti teško dostupno ili ne postoji. Antraks je vrsta biološke borbe koja se, ako se proizvede ispravno, može širiti zrakom na širokom području i prilično brzo zaraziti svoju metu. Budući da se učinci antraksa ne prenose između ljudi ili životinja normalnim putem kao što je disanje, antraks se lako može ograničiti na ciljano područje. Međutim, ovo područje može biti vrlo veliko i ostat će kontaminirano još dugo vremena nakon što je oružje pušteno u vodu zbog povećane snage zagađivača koji je proizveden posebno kao biološko oružje.
Ostali agensi koji su korišteni ili planirani kao biološki rat protiv ljudi uključuju koleru, velike boginje i žutu groznicu, da spomenemo samo neke. Budući da postoji toliko vrsta, oni koji se bave obranom od bioloških napada moraju biti spremni identificirati vrstu klica ili toksina što je prije moguće kroz širok raspon metoda. Otrovi i otrovi koje proizvodi biološko oružje često se također smatraju vrstama kemijskog rata. Postoji velik dio istraživanja koji se istovremeno provodi u oba područja biološkog i kemijskog ratovanja budući da oni mogu biti usko međusobno povezani.