Mikrokimerizam je pojava u kojoj tijelo organizma sadrži mali broj stanica drugog organizma. Za razliku od tetragametskog himerizma, mikrokimerizam se stječe. U tetragametskom himerizmu, s druge strane, urođena osobina se javlja kada se dvije neidentične zigote ili blastociste spoje prije implantacije i razviju se u jedan organizam sastavljen od dvije stanične populacije, svaka sa svojim vlastitim različitim genima. Mikrokimerizam se javlja kod mnogih vrsta, uključujući ljude.
Mikrohimerizam kod ljudi se obično javlja tijekom trudnoće. Stanice imunološkog sustava fetusa mogu ući u majku kroz placentu, gdje mogu preživjeti i nastaviti se razmnožavati kroz mitozu. U nekim slučajevima, potomci ovih fetalnih stanica ostaju u majci desetljećima kasnije. Isti proces obrnuti može rezultirati populacijama majčinih imunoloških stanica koje žive u fetusu, iako je to rjeđe. Također može biti posljedica transplantacije organa i transfuzije krvi.
Postoje neka istraživanja koja ukazuju da mikrokimerizam može uzrokovati neke autoimune poremećaje, kao što je lupus. Prisutnost majčinih imunoloških stanica okrivljuje se za neke autoimune bolesti od kojih boluju djeca, kao što je juvenilni dermatomiozitis. Neki slučajevi sistemske skleroze, bolesti koja oštećuje kožu, zglobove i neke unutarnje organe, mogu biti uzrokovani fetalnim imunološkim stanicama koje žive u majci, a neke studije povezuju prisutnost fetalnih imunoloških stanica s rakom dojke. Autoimuni poremećaji češći su u žena nego u muškaraca, a kao mogući razlog za to su predloženi učinci fetalnih stanica.
Međutim, implikacije istraživanja u ovom području još uvijek su dvosmislene. Česta prisutnost fetalnih ili majčinih imunoloških stanica u tkivima zahvaćenim ovim bolestima može ukazivati na to da one uzrokuju ili doprinose bolesti, ali također može značiti da su strane stanice prisutne jer pomažu u borbi protiv bolesti ili ublažavaju štetu. Stoga se također pretpostavlja da neki mikrokimerizam zapravo može biti koristan.
Kod nekih životinja, poput goveda, uobičajeno je da se posteljica u maternici spoji i dijele cirkulaciju krvi. Kao rezultat toga, stanice mogu lako proći između bratskih blizanaca u maternici, što rezultira mikrokimerizmom. U slučaju ovako spojenog muškog i ženskog fetusa, izmjena spolnih hormona tijekom razvoja uzrokuje djelomično maskuliniziranje ženke. To sprječava normalan razvoj reproduktivnih organa i rezultira onim što je poznato kao freemartin, sterilna ženka koja može imati djelomično muške karakteristike. Prisutnost mikrokimerizma koristi se za potvrdu da je ženka freemartin, jer će njezina krv sadržavati stanice s muškim genetskim materijalom koji potječe od njezina blizanca.