Pročišćavanje antitijela je proces u kojem se antitijela ekstrahiraju iz antiseruma koji sadrži mješavinu spojeva. Jednom pročišćena, antitijela se mogu koristiti na razne načine. Taj se proces može izvesti u laboratorijima koji nude uslugu pročišćavanja antitijela, a ljudi mogu i sami, ako imaju potrebnu opremu i alate. To se može učiniti u laboratoriju u kojem ljudi žele brze preokrete za svoja istraživanja ili kada su istraživači zabrinuti za zaštitu integriteta izvornog istraživanja.
Jedan od glavnih izvora antitijela je antiserum proizveden u životinja. U tom slučaju životinji se više puta ubrizgava antigen dok ne razvije antitijela, a njezina krv se koristi za pripremu antiseruma koji se može pročistiti kako bi se pristupilo antitijelima. Drugi izvor antitijela je klonirana stanica koja proizvodi antitijela kao dio kolonije identičnih stanica; ova metoda se koristi za masovnu proizvodnju takozvanih “monoklonskih antitijela”.
Postoji nekoliko tehnika koje se mogu koristiti za pročišćavanje antitijela. Najprikladnija tehnika ovisi o mediju koji se pročišćava. Protutijela proizvedena u jajima, na primjer, tretiraju se drugačije od antiseruma iz zeca ili koze. Afinitetna kromatografija i protein A/G koriste se u potrazi za pročišćavanjem antitijela, u svrhu izolacije antitijela iz ostatka otopine. Klasično pročišćavanje antitijela oslanja se na korištenje tvari koja se veže na specifično antitijelo, držeći se na mjestu dok se ostatak otopine ispere.
Za istraživanje mogu biti potrebne relativno male količine antitijela. U drugim slučajevima, potrebno ih je stvarati u velikim količinama jer se koriste u terapiji ili dijagnostici. Na primjer, antitijela se mogu koristiti s ELISA testom kako bi se utvrdilo je li netko bio izložen virusu. Test može otkriti jesu li odgovarajuća protutijela prisutna u krvi iu kojoj koncentraciji, što može biti važno pri određivanju težine i opsega infekcije. U ovom slučaju, potrebno je imati pri ruci dovoljne količine antitijela kako bi se izbjeglo vrijeme kašnjenja s testiranjem.
Istraživači mogu naručiti prilagođena antitijela preko tvrtki koje proizvode antitijela. Te tvrtke često pružaju cijeli paket, opskrbljujući istraživača pročišćenim antitijelima na kraju određenog vremenskog razdoblja. Trošak proizvodnje i pročišćavanja antitijela varira, ovisno o tvrtki i antitijelima koje se proizvode.